#NEXUS
BEGIN TAXA;
    TITLE Untitled_TAXA_Block_1;
    DIMENSIONS NTax = 17;
    TAXLABELS human tarsier bushbaby hare rabbit cow sheep pig elephseal rat mouse hamster marsupial duck chicken xenlaev xentrop;
END;
BEGIN CHARACTERS;
    TITLE Untitled_DATA_Block_1;
    LINK TAXA = Untitled_TAXA_Block_1;
    DIMENSIONS NChar=432;
    FORMAT Datatype=DNA;
Matrix
human         CTGACTCCTGAGGAGAAGTCTGCCGTTACTGCCCTGTGGGGCAAGGTGAACGTGGATGAAGTTGGTGGTGAGGCCCTGGGCAGGCTGCTGGTGGTCTACCCTTGGACCCAGAGGTTCTTTGAGTCCTTTGGGGATCTGTCCACTCCTGATGCTGTTATGGGCAACCCTAAGGTGAAGGCTCATGGCAAGAAAGTGCTCGGTGCCTTTAGTGATGGCCTGGCTCACCTGGACAACCTCAAGGGCACCTTTGCCACACTGAGTGAGCTGCACTGTGACAAGCTGCACGTGGATCCTGAGAACTTCAGGCTCCTGGGCAACGTGCTGGTCTGTGTGCTGGCCCATCACTTTGGCAAAGAATTCACCCCACCAGTGCAGGCTGCCTATCAGAAAGTGGTGGCTGGTGTGGCTAATGCCCTGGCCCACAAGTATCAC
tarsier       CTGACTGCTGAAGAGAAGGCCGCCGTCACTGCCCTGTGGGGCAAGGTAGACGTGGAAGATGTTGGTGGTGAGGCCCTGGGCAGGCTGCTGGTCGTCTACCCATGGACCCAGAGGTTCTTTGACTCCTTTGGGGACCTGTCCACTCCTGCCGCTGTTATGAGCAATGCTAAGGTCAAGGCCCATGGCAAAAAGGTGCTGAACGCCTTTAGTGACGGCATGGCTCATCTGGACAACCTCAAGGGCACCTTTGCTAAGCTGAGTGAGCTGCACTGTGACAAATTGCACGTGGATCCTGAGAATTTCAGGCTCTTGGGCAATGTGCTGGTGTGTGTGCTGGCCCACCACTTTGGCAAAGAATTCACCCCGCAGGTTCAGGCTGCCTATCAGAAGGTGGTGGCTGGTGTGGCTACTGCCTTGGCTCACAAGTACCAC
bushbaby      CTGACTCCTGATGAGAAGAATGCCGTTTGTGCCCTGTGGGGCAAGGTGAATGTGGAAGAAGTTGGTGGTGAGGCCCTGGGCAGGCTGCTGGTTGTCTACCCATGGACCCAGAGGTTCTTTGACTCCTTTGGGGACCTGTCCTCTCCTTCTGCTGTTATGGGCAACCCTAAAGTGAAGGCCCACGGCAAGAAGGTGCTGAGTGCCTTTAGCGAGGGCCTGAATCACCTGGACAACCTCAAGGGCACCTTTGCTAAGCTGAGTGAGCTGCATTGTGACAAGCTGCACGTGGACCCTGAGAACTTCAGGCTCCTGGGCAACGTGCTGGTGGTTGTCCTGGCTCACCACTTTGGCAAGGATTTCACCCCACAGGTGCAGGCTGCCTATCAGAAGGTGGTGGCTGGTGTGGCTACTGCCCTGGCTCACAAATACCAC
hare          CTGTCCGGTGAGGAGAAGTCTGCGGTCACTGCCCTGTGGGGCAAGGTGAATGTGGAAGAAGTTGGTGGTGAGACCCTGGGCAGGCTGCTGGTTGTCTACCCATGGACCCAGAGGTTCTTCGAGTCCTTTGGGGACCTGTCCACTGCTTCTGCTGTTATGGGCAACCCTAAGGTGAAGGCTCATGGCAAGAAGGTGCTGGCTGCCTTCAGTGAGGGTCTGAGTCACCTGGACAACCTCAAAGGCACCTTCGCTAAGCTGAGTGAACTGCATTGTGACAAGCTGCACGTGGATCCTGAGAACTTCAGGCTCCTGGGCAACGTGCTGGTTATTGTGCTGTCTCATCACTTTGGCAAAGAATTCACTCCTCAGGTGCAGGCTGCCTATCAGAAGGTGGTGGCTGGTGTGGCCAATGCCCTGGCTCACAAATACCAC
rabbit        CTGTCCAGTGAGGAGAAGTCTGCGGTCACTGCCCTGTGGGGCAAGGTGAATGTGGAAGAAGTTGGTGGTGAGGCCCTGGGCAGGCTGCTGGTTGTCTACCCATGGACCCAGAGGTTCTTCGAGTCCTTTGGGGACCTGTCCTCTGCAAATGCTGTTATGAACAATCCTAAGGTGAAGGCTCATGGCAAGAAGGTGCTGGCTGCCTTCAGTGAGGGTCTGAGTCACCTGGACAACCTCAAAGGCACCTTTGCTAAGCTGAGTGAACTGCACTGTGACAAGCTGCACGTGGATCCTGAGAACTTCAGGCTCCTGGGCAACGTGCTGGTTATTGTGCTGTCTCATCATTTTGGCAAAGAATTCACTCCTCAGGTGCAGGCTGCCTATCAGAAGGTGGTGGCTGGTGTGGCCAATGCCCTGGCTCACAAATACCAC
cow           CTGACTGCTGAGGAGAAGGCTGCCGTCACCGCCTTTTGGGGCAAGGTGAAAGTGGATGAAGTTGGTGGTGAGGCCCTGGGCAGGCTGCTGGTTGTCTACCCCTGGACTCAGAGGTTCTTTGAGTCCTTTGGGGACTTGTCCACTGCTGATGCTGTTATGAACAACCCTAAGGTGAAGGCCCATGGCAAGAAGGTGCTAGATTCCTTTAGTAATGGCATGAAGCATCTCGATGACCTCAAGGGCACCTTTGCTGCGCTGAGTGAGCTGCACTGTGATAAGCTGCATGTGGATCCTGAGAACTTCAAGCTCCTGGGCAACGTGCTAGTGGTTGTGCTGGCTCGCAATTTTGGCAAGGAATTCACCCCGGTGCTGCAGGCTGACTTTCAGAAGGTGGTGGCTGGTGTGGCCAATGCCCTGGCCCACAGATATCAT
sheep         CTGACTGCTGAGGAGAAGGCTGCCGTCACCGGCTTCTGGGGCAAGGTGAAAGTGGATGAAGTTGGTGCTGAGGCCCTGGGCAGGCTGCTGGTTGTCTACCCCTGGACTCAGAGGTTCTTTGAGCACTTTGGGGACTTGTCCAATGCTGATGCTGTTATGAACAACCCTAAGGTGAAGGCCCATGGCAAGAAGGTGCTAGACTCCTTTAGTAACGGCATGAAGCATCTCGATGACCTCAAGGGCACCTTTGCTCAGCTGAGTGAGCTGCACTGTGATAAGCTGCACGTGGATCCTGAGAACTTCAGGCTCCTGGGCAACGTGCTGGTGGTTGTGCTGGCTCGCCACCATGGCAATGAATTCACCCCGGTGCTGCAGGCTGACTTTCAGAAGGTGGTGGCTGGTGTTGCCAATGCCCTGGCCCACAAATATCAC
pig           CTGTCTGCTGAGGAGAAGGAGGCCGTCCTCGGCCTGTGGGGCAAAGTGAATGTGGACGAAGTTGGTGGTGAGGCCCTGGGCAGGCTGCTGGTTGTCTACCCCTGGACTCAGAGGTTCTTCGAGTCCTTTGGGGACCTGTCCAATGCCGATGCCGTCATGGGCAATCCCAAGGTGAAGGCCCACGGCAAGAAGGTGCTCCAGTCCTTCAGTGACGGCCTGAAACATCTCGACAACCTCAAGGGCACCTTTGCTAAGCTGAGCGAGCTGCACTGTGACCAGCTGCACGTGGATCCTGAGAACTTCAGGCTCCTGGGCAACGTGATAGTGGTTGTTCTGGCTCGCCGCCTTGGCCATGACTTCAACCCGAATGTGCAGGCTGCTTTTCAGAAGGTGGTGGCTGGTGTTGCTAATGCCCTGGCCCACAAGTACCAC
elephseal     TTGACGGCGGAGGAGAAGTCTGCCGTCACCTCCCTGTGGGGCAAAGTGAAGGTGGATGAAGTTGGTGGTGAAGCCCTGGGCAGGCTGCTGGTTGTCTACCCCTGGACTCAGAGGTTCTTTGACTCCTTTGGGGACCTGTCCTCTCCTAATGCTATTATGAGCAACCCCAAGGTCAAGGCCCATGGCAAGAAGGTGCTGAATTCCTTTAGTGATGGCCTGAAGAATCTGGACAACCTCAAGGGCACCTTTGCTAAGCTCAGTGAGCTGCACTGTGACCAGCTGCATGTGGATCCCGAGAACTTCAAGCTCCTGGGCAATGTGCTGGTGTGTGTGCTGGCCCGCCACTTTGGCAAGGAATTCACCCCACAGATGCAGGGTGCCTTTCAGAAGGTGGTAGCTGGTGTGGCCAATGCCCTCGCCCACAAATATCAC
rat           CTAACTGATGCTGAGAAGGCTGCTGTTAATGCCCTGTGGGGAAAGGTGAACCCTGATGATGTTGGTGGCGAGGCCCTGGGCAGGCTGCTGGTTGTCTACCCTTGGACCCAGAGGTACTTTGATAGCTTTGGGGACCTGTCCTCTGCCTCTGCTATCATGGGTAACCCTAAGGTGAAGGCCCATGGCAAGAAGGTGATAAACGCCTTCAATGATGGCCTGAAACACTTGGACAACCTCAAGGGCACCTTTGCTCATCTGAGTGAACTCCACTGTGACAAGCTGCATGTGGATCCTGAGAACTTCAGGCTCCTGGGCAATATGATTGTGATTGTGTTGGGCCACCACCTGGGCAAGGAATTCACCCCCTGTGCACAGGCTGCCTTCCAGAAGGTGGTGGCTGGAGTGGCCAGTGCCCTGGCTCACAAGTACCAC
mouse         CTGACTGATGCTGAGAAGTCTGCTGTCTCTTGCCTGTGGGCAAAGGTGAACCCCGATGAAGTTGGTGGTGAGGCCCTGGGCAGGCTGCTGGTTGTCTACCCTTGGACCCAGCGGTACTTTGATAGCTTTGGAGACCTATCCTCTGCCTCTGCTATCATGGGTAATCCCAAGGTGAAGGCCCATGGCAAAAAGGTGATAACTGCCTTTAACGAGGGCCTGAAAAACCTGGACAACCTCAAGGGCACCTTTGCCAGCCTCAGTGAGCTCCACTGTGACAAGCTGCATGTGGATCCTGAGAACTTCAGGCTCCTAGGCAATGCGATCGTGATTGTGCTGGGCCACCACCTGGGCAAGGATTTCACCCCTGCTGCACAGGCTGCCTTCCAGAAGGTGGTGGCTGGAGTGGCCACTGCCCTGGCTCACAAGTACCAC
hamster       CTGACTGATGCTGAGAAGGCCCTTGTCACTGGCCTGTGGGGAAAGGTGAACGCCGATGCAGTTGGCGCTGAGGCCCTGGGCAGGTTGCTGGTTGTCTACCCTTGGACCCAGAGGTTCTTTGAACACTTTGGAGACCTGTCTCTGCCAGTTGCTGTCATGAATAACCCCCAGGTGAAGGCCCATGGCAAGAAGGTGATCCACTCCTTCGCTGATGGCCTGAAACACCTGGACAACCTGAAGGGCGCCTTTTCCAGCCTGAGTGAGCTCCACTGTGACAAGCTGCACGTGGATCCTGAGAACTTCAAGCTCCTGGGCAATATGATCATCATTGTGCTGATCCACGACCTGGGCAAGGACTTCACTCCCAGTGCACAGTCTGCCTTTCATAAGGTGGTGGCTGGTGTGGCCAATGCCCTGGCTCACAAGTACCAC
marsupial     TTGACTTCTGAGGAGAAGAACTGCATCACTACCATCTGGTCTAAGGTGCAGGTTGACCAGACTGGTGGTGAGGCCCTTGGCAGGATGCTCGTTGTCTACCCCTGGACCACCAGGTTTTTTGGGAGCTTTGGTGATCTGTCCTCTCCTGGCGCTGTCATGTCAAATTCTAAGGTTCAAGCCCATGGTGCTAAGGTGTTGACCTCCTTCGGTGAAGCAGTCAAGCATTTGGACAACCTGAAGGGTACTTATGCCAAGTTGAGTGAGCTCCACTGTGACAAGCTGCATGTGGACCCTGAGAACTTCAAGATGCTGGGGAATATCATTGTGATCTGCCTGGCTGAGCACTTTGGCAAGGATTTTACTCCTGAATGTCAGGTTGCTTGGCAGAAGCTCGTGGCTGGAGTTGCCCATGCCCTGGCCCACAAGTACCAC
duck          TGGACAGCCGAGGAGAAGCAGCTCATCACCGGCCTCTGGGGCAAGGTCAATGTGGCCGACTGTGGAGCTGAGGCCCTGGCCAGGCTGCTGATCGTCTACCCCTGGACCCAGAGGTTCTTCGCCTCCTTCGGGAACCTGTCCAGCCCCACTGCCATCCTTGGCAACCCCATGGTCCGTGCCCATGGCAAGAAAGTGCTCACCTCCTTCGGAGATGCTGTGAAGAACCTGGACAACATCAAGAACACCTTCGCCCAGCTGTCCGAGCTGCACTGCGACAAGCTGCACGTGGACCCTGAGAACTTCAGGCTCCTGGGTGACATCCTCATCATCGTCCTGGCCGCCCACTTCACCAAGGATTTCACTCCTGACTGCCAGGCCGCCTGGCAGAAGCTGGTCCGCGTGGTGGCCCACGCTCTGGCCCGCAAGTACCAC
chicken       TGGACTGCTGAGGAGAAGCAGCTCATCACCGGCCTCTGGGGCAAGGTCAATGTGGCCGAATGTGGGGCCGAAGCCCTGGCCAGGCTGCTGATCGTCTACCCCTGGACCCAGAGGTTCTTTGCGTCCTTTGGGAACCTCTCCAGCCCCACTGCCATCCTTGGCAACCCCATGGTCCGCGCCCACGGCAAGAAAGTGCTCACCTCCTTTGGGGATGCTGTGAAGAACCTGGACAACATCAAGAACACCTTCTCCCAACTGTCCGAACTGCATTGTGACAAGCTGCATGTGGACCCCGAGAACTTCAGGCTCCTGGGTGACATCCTCATCATTGTCCTGGCCGCCCACTTCAGCAAGGACTTCACTCCTGAATGCCAGGCTGCCTGGCAGAAGCTGGTCCGCGTGGTGGCCCATGCCCTGGCTCGCAAGTACCAC
xenlaev       TGGACAGCTGAAGAGAAGGCCGCCATCACTTCTGTATGGCAGAAGGTCAATGTAGAACATGATGGCCATGATGCCCTGGGCAGGCTGCTGATTGTGTACCCCTGGACCCAGAGATACTTCAGTAACTTTGGAAACCTCTCCAATTCAGCTGCTGTTGCTGGAAATGCCAAGGTTCAAGCCCATGGCAAGAAGGTTCTTTCAGCTGTTGGCAATGCCATTAGCCATATTGACAGTGTGAAGTCCTCTCTCCAACAACTCAGTAAGATCCATGCCACTGAACTGTTTGTGGACCCTGAGAACTTTAAGCGTTTTGGTGGAGTTCTGGTCATTGTCTTGGGTGCCAAACTGGGAACTGCCTTCACTCCTAAAGTTCAGGCTGCTTGGGAGAAATTCATTGCAGTTTTGGTTGATGGTCTTAGCCAGGGCTATAAC
xentrop       TGGACAGCTGAAGAAAAAGCAACCATTGCTTCTGTGTGGGGGAAAGTCGACATTGAACAGGATGGCCATGATGCATTATCCAGGCTGCTGGTTGTTTATCCCTGGACTCAGAGGTACTTCAGCAGTTTTGGAAACCTCTCCAATGTCTCCGCTGTCTCTGGAAATGTCAAGGTTAAAGCCCATGGAAATAAAGTCCTGTCAGCTGTTGGCAGTGCAATCCAGCATCTGGATGATGTGAAGAGCCACCTTAAAGGTCTTAGCAAGAGCCATGCTGAGGATCTTCATGTGGATCCCGAAAACTTCAAGCGCCTTGCGGATGTTCTGGTGATCGTTCTGGCTGCCAAACTTGGATCTGCCTTCACTCCCCAAGTCCAAGCTGTCTGGGAGAAGCTCAATGCAACTCTGGTGGCTGCTCTTAGCCATGGCTACTTC
;
END;
BEGIN MRBAYES;
    charset non_coding = 1 - 90 358 - 432;
    charset coding = 91 - 357;
    partition region = 2 : non_coding , coding;
    set partition = region;
    lset applyto = ( 2 ) nucmodel = codon;
    prset ratepr = variable;
    mcmcp ngen = 100 nchains = 1 printfreq = 10 samplefreq = 10;
END;
