CLUSTAL FORMAT for T-COFFEE Version_11.00 [http://www.tcoffee.org] [MODE: 3dcoffee ], CPU=0.00 sec, SCORE=1000, Nseq=5, Len=187 

sequence1       -STGSATTTPIDS-L-DDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGS-SSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNA--KASLDS
sequence2       AASGVATNTPTAN---DEEYITPVTIG--GTTLNLNFDTGSADLWVFSTELPASQQSGHSVYNP--SATGKELSGYTWSISYGDGS-SASGNVFTDSVTVGGVTAHGQAVQAAQQISAQFQQDTNNDGLLGLAFSSINTVQPQSQTTFFDTV--KSSLAQ
1cms            ---GEVASVPLTNYL-DSQYFGKIYLGTPPQEFTVLFDTGSSDFWVPSIYCKSNACKNHQRFDPRKSSTFQNL-GKPLSIHYGTGS-MQ-GILGYDTVTVSNIVDIQQTVGLSTQEPGDVFTYAEFDGILGMAYPSLAS---EYSIPVFDNMMNRHLVAQ
sequence4       ---AGVGTVPMTDYGNDIEYYGQVTIGTPGKKFNLDFDTGSSDLWIASTLCTNCG-SGQTKYDPNQSSTYQAD-GRTWSISYGDGSSAS-GILAKDNVNLGGLLIKGQTIELAKREAASFAS-GPNDGLLGLGFDTITT--VRGVKTPMDNLISQGLISR
4pep            -----IGDEPLENYL-DTEYFGTIGIGTPAQDFTVIFDTGSSNLWVPSVYCSSLACSDHNQFNPDDSSTFEAT-SQELSITYGTGS-MT-GILGYDTVQVGGISDTNQIFGLSETEPGSFLYYAPFDGILGLAYPSISA---SGATPVFDNLWDQGLVSQ
                         *  .   *  *   : :*     :.: *****:::*: *        ..:  : *  *:* :   .   ** ** **    * :  *.* :..:    * .  :   ....      **:**:.: :: :       . :*.   :  :  

sequence1       PVFTADL--GYH-APGTYNFGFIDTTA
sequence2       PLFAVAL--KHQ-QPGVYDFGFIDSSK
1cms            DLFSVYMD-RNG-QESMLTLGAIDPSY
sequence4       PIFGVYLGKAKNGGGGEYIFGGYDSTK
4pep            DLFSVYLS-SNDDSGSVVLLGGIDSSY
                 :* . :        .   :*  *.: 



