# Ligation

Die Ligation ist häufig der nächste Schritt nach dem Restriktionsverdau. Über des Menü "Werkzeuge/Ligation" oder über das Tastenkürzel "Strg-L" kann der Ligationsdialog aufgerufen werden. In der linken Liste werden alle gegenwärtig geladenen, linearen DNA-Sequenzen angezeigt. Nur markierte DNA-Sequenzen werden in der Ligation berücksichtigt. Automatisch werden dabei alle Sequenzen mit "sticky ends" markiert. Für Blunt-End-Ligationen müssen die entsprechenden Sequenzen manuell markiert werden.

Die rechte Liste zeigt alle Ligationsprodukte an, die aus den aktuell markierten Sequenzen entstehen können. Dabei werden Poly-Ligationen (z.B. "A-B-A-B-A-B-...") nicht angezeigt. Bei zirkulären Produkten werden beide logische Formen (z.B. "A-B" und "B-A" für die Ligation von A und B) angezeigt. Beide sind der Sequenz nach identisch.

Durch den "Ligieren!"-Button werden alle markierten Produkte aus der rechten Spalte erzeugt. Die Produktnamen werden aus den Ausgangssequenzen zusammengesetzt und bedürfen oft der manuellen Nachbearbeitung. Der Ligationsverlauf wird der Beschreibung der Produkte angefügt.

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